Los experimentos en marcha. Primeros resultados

Hola

Tras el pasado Miércoles/Jueves, se quedaron incubándose varios experimentos.

Por un lado, estaba nuestra primera placa de diluciones seriadas en la que debíamos de responder a la pregunta de cuanto fago hay en cada uno de los tres tubos…

El resultado es el que se observa en la figura:

Como podeis ver, ya se ven fagos y ya se ven en alguno de los puntos… En la próxima reunión online discutiremos y trataremos de explicar lo que ha pasado…

Por lo pronto se me ocurren muchas preguntas, la primera de todas es: 

¿¿qué cantidad de fago hay en los tubos??? Quien responde??

Paralelamente os recuerdo, se tomaron muestras de los suelos del IES…

En concreto, de una zona de jardín con muchas herbáceas (zona A) y una zona cercana al antiguo “huerto” (B) y que lamentablemente se ha usado para prácticas de FP en albañilería… .

Sobre suelo de las muestras A, se han plantado semillas germinadas de alfalfa que nos permitirán obtener suelo denominado “rizosférico" (ligado íntimamente a las plantas de alfalfa) para nuestros análisis…

Estas plantas, debemos de cuidarlas durante al menos 30 dias... Van a ser una muestra importante en el desarrollo de nuestro proyecto!!!. Os recuerdo, la primera pregunta a responder será, existen fagos de S meliloti en alguna de estas muestras???.

En breve comenzaremos nuestra primera discusión online para analizar las posibilidades….

Este próximo jueves 22 Enero a las 17:00 tenemos la cita!!!

Ya estamos encaminados!!!!!

 

 

Nuestro primer dia Experimental

 Hola de nuevo 

El pasado Miércoles 14 de Enero comenzó nuestro proyecto.

Nuestro investigador nos explicó las líneas básicas de nuestro proyecto, aspectos básicos de lo que vamos a hacer y sobre todo la pregunta a responder (mirad en recursos la presentación del primer día: "Presentación Primer día)

“¿¿existen fagos de la bacteria Sinorhizobium meliloti en el suelo de los jardines del instituto??”

Para recorrer todo ese camino, debemos familiarizarnos con las herramientas de trabajo en microbiología:

Trabajar con placas de bacterias,

Trabajar con pipetas automáticas y volúmenes muy pequeños, desde microlitros (2, 10, 20??) hasta mililitros (1 ml). 

Y es que este manejo de los volúmenes es clave en el proyecto, pues aprendimos que, para detectar los fagos, es necesario trabajar con lo que se conoce como diluciones seriadas. 

Nuestro investigador nos planteó un primer experimento control.

Se trataba de determinar la cantidad de Fago presente en tres tubos: 1, 2 y 3.

Para ello, de cada tubo (500 ul) se realizaron diluciones seriadas de 10 en 10 volúmenes tal y como se observan en el esquema de más arriba.

Y se pipetearon 10 ul sobre un “césped” del hospedador de este fago control, la bacteria S. meliloti 

Se prepararon dos placas de tal manera que una se quedó en una “incubadora “ del Taller del IES, (una caja de carton sobre uno de los radiadores con el cartel de "no tocar".  jajajajaja

 Y la otra se la llevo nuestro investigador al centro de Investigación. En un par de dias veremos nuestros primeros resultados. que habrá que analizar y responder a la pregunta de partida: 

cuantos fagos (en número hay en cada tubo eppendorf (1, 2 y 3???)

Pero... aqui no se acabó la Jornada!!!!

Debíamos seleccionar nuestro material de partida, esto es: 4 muestras de suelo del entorno de nuestro centro.  Pero.. qué suelos?????

Hablamos de un suelo A: muestras A1 y A2 sobre las que habrá que buscar las coordenadas georreferénciales (nuestro profesor Antonio nos ayudará en ello...)!!!

Y un suelo B: muestras B1 y B2 

De manera paralela, nuestros profesores (Antonio y Juan Antonio) también han lanzado experimentos de siembra de semillas de alfalfa - que ya se llevaron germinadas - sobre uno de los suelos: el suelo A, Este suelo es en el que más posibilidades habría de que crezcan. Sobre el porqué se estan realizando estos experimentos, lo sabremos en las próxima reunión!!!!

Señores!!!! Nuestro proyecto ya ha comenzado!!!! Tomaya !!!!

BIENVENIDOS comenzamos DNA y Resistencia a Fagos IV

    Hola a todos y bienvenidos al 4º proyecto CAOS centrado en la temática de encontrar virus en el medioambiente. En este caso el suelo. A diferencia de los tres anteriores, este año tiene si cabe una incertidumbre mayor. Los desafíos que vamos a plantear se entroncan directamente con nuestra línea de investigación que venimos desarrollando en el grupo desde hace ya unos años (Caracterización de nuevos sistemas de defensa en bacterias asociados a unos genes denominados Reverso transcriptasas; los sistemas DRT (del inglés Defense Reverse Transcriptases Systems) cuenta de Twitter: @TORO_LAB).

Al final de este proyecto deberíamos familiarizarnos con el papel de los fagos (virus que infectan a bacterias) como garantes de la biodiversidad. Con el objetivo planteado en este proyecto, aún por definir del todo, intentaremos establecer la presencia de estos seres vivos (Fagos que infectan a bacterias) en nuestro huerto escolar...

Todos nuestros avances y resultados los iremos plasmando en este blog en el cual también tendremos recursos, enlaces, etc. Todo aquello que nos permita hacer de este proyecto una experiencia de la que nos sintamos muy orgullosos y de la que hagamos partícipes a todo nuestro entorno: nuestros padres, nuestros compañeros de clase, profesores, amigos... Esta forma de dar a conocer nuestros resultados no es nueva; ejemplo de ello lo tenéis en los blog de proyectos anteriores que podréis visitar haciendo “click”  más arriba.

Y ya nada más que pedir vuestra colaboración también en este, nuestro blog. Pero no solo con vuestras aportaciones, sino con las de todos aquellos a los que podamos hacer partícipes de nuestras investigaciones. Seguro que ellos también pueden añadir comentarios interesantes que dinamicen nuestro blog.

Y por ahora nada más. En breve tendremos nuestra primera sesión.

Ánimo, entre todos vamos a hacer un gran proyecto

Dr Francisco Martínez-Abarca

EEZ-CSIC